Eesti ja Põhja-Makedoonia vahel on sõlmitud järgnevad lepingud:

• Eesti Vabariigi valitsuse ja Makedoonia Vabariigi valitsuse vaheline reisijate- ja autokaubaveo kokkulepe (jõustus 22.08.2000).
• Eesti Vabariigi ja Makedoonia Vabariigi vaheline tulumaksudega topeltmaksustamise vältimise ning maksudest hoidumise tõkestamise leping (allkirjastatud 20.11.2008, jõustunud 21.05.2009)
• Eesti Vabariigi valitsuse ja Makedoonia Vabariigi valitsuse salastatud teabe vahetamise ja vastastikuse kaitse kokkulepe (allkirjastatud 20.11.2008, jõustunud 01.06.2009)
• Eesti Vabariigi valitsuse ja Makedoonia Vabariigi valitsuse Euroopa Ühenduse ja endise Jugoslaavia Makedoonia Vabariigi vahelise ebaseaduslikult riigis elavate isikute tagasivõtmise lepingu rakendamise protokoll (rakendusprotokoll) (allkirjastatud 23.04.2010, jõustunud 23.07.2010)

Üldiseloomustus 

Täpsemaid andmeid ekspordi ja impordi kohta vaata Statistikaameti rakendusest. 

Eesti ja Põhja-Makedoonia vaheline kaitsekoostöö sai alguse 2004. aastal, mil sõlmiti kahepoolne kaitsealase koostöö raamleping. Eestis on Balti Kaitsekolledži kursusel Joint Command and General Staff Course osalenud mitmeid Põhja-Makedoonia sõjaväelasi (alates 2004. aastast kokku kaheksa). Lisaks on kaks makedoonlast osalenud Baltdefcoli maaväe kursusel 2007. ja 2009. aastal. Põhja-Makedoonia esindajate osalust on sponsoritena rahastanud Holland ja Taani.

Eesti on osalenud Põhja-Makedoonias järgmistel rahvusvahelistel missioonidel:

• 31.03.2003 – 15.12.2003 kestnud EL-i sõjalise missiooni Concordia raames osales Eesti ühe staabiohvitseriga.
• 15.12.2003 - 14.12.2005 kestnud EL-i politseimissioonis Proxima osales Eesti ühe politseiohvitseriga.

Eesti on toetanud Põhja-Makedoonias mitmete projektide läbiviimist ning peamiselt on need projektid olnud suunatud Põhja-Makedoonia e-valitsemise arendamisele.

Viimastel aastatel toimunud projekte:

• Juunis 2019 viibis Eestis õppevisiidil kaks Põhja-Makedoonia ajakirjanikku.

• Eesti on arengukoostöö eelarvest toetanud stipendiumiga Põhja-Makedoonia diplomaatide õppimist Eesti Diplomaatide Koolis 2011/2012 ning 2013/2014 õppeaastal.

• 2014. aastal toetati arengukoostöö raames Põhja-Makedoonias telefonipõhise esmatasandi tervishoiunõustamise käivitamist. Projekti pikendati 2015. a. maini.

• Oktoobris 2014 viibis Eestis õppevisiidil kolm Põhja-Makedoonia ajakirjanikku, mida samuti finantseeriti Eesti arengukoostöö eelarvest.

• Märtsis 2015 osalesid Põhja-Makedoonia esindajad/ettevõtjad Eesti KTK poolt teostatud majandus- ja ettevõtlussuhete arendamise projektis, mida finantseeriti Eesti arengukoostöö eelarvest.

• Septembris 2015 viisid Taiexi abil sotsiaalministeeriumi ja rahandusministeeriumi personalijuht Põhja-Makedoonias läbi kahepäevase tööturualase seminari, oktoobris 2015 viibisid Tallinnas Põhja-Makedoonia eksperdid, teemaks töövaldkonna seadusandlus. 

• Eesti osaleb põhja-Makedoonias koos Hollandi ja Sloveeniaga Twinningu projekis põllumajanduse ja põllumajandusregistrite valdkonnas (Further strengthening of Agency for Financial Support of Agriculture and Rural Development (AFSARD) and preparing the Agency for the programming period 2014 – 2020).

• 3.03. 2016 sõlmiti Põhja-Makedoonia - Eesti auditorikogude vaheline vastastikuse mõistmise memorandum. Põhja-Makedoonia on huvitatud Audiitorkogu loodud auditeerimistarkvara E-dok kasutuselevõtust Põhja-Makedoonias.

• 17.-19.05. 2016 viisid Taiexi toel siseministeeriumi eksperdid läbi koolituse "The Use of Digital Certificates for Public Services".

• 31.05. 2016 E-riigi Akadeemia korraldatud e-riigi konverentsil osales Põhja-Makedoonia infoühiskonna- ja administratsiooniministeeriumi kantsler Jahi Jahija. Konverentsil toimus eraldi Balkani ümarlaud, kus riigid esitlesid e-riigi hetke seisu.

• 23.-25.08. 2016 viis Teabeamet Taiexi raames läbi koolituse salastatud teabe teemal.

• Üks Eesti ekspert viis 2016. aastal WHO rahastusel läbi statistika alaseid koolitusi Põhja-Makedoonia tervisesektori ametnikele.

• MTÜ Eesti Abikeskused viis Põhja-Makedoonias ellu Euroopa Liidu IPA programmist rahastatud projekti „Increasing the supply of the qualified work-force among the labour market risk-groups in Macedonia“ perioodil jaanuar 2016  - märts 2017. Tegemist on tööturuprojektiga, mille raames koolitati töötuid, mitteaktiivseid ja muid tööturu sihtgruppe Skopjes ja Ohridi piirkonnas.